Le « Bureau de coordination énergie éolienne » a été institué en 2006 par le Ministère français délégué à l’Industrie et le Ministère fédéral allemand de l’Environnement. En 2013, à l’occasion du 50e anniversaire du Traité de l’Élysée, le Bureau a été transformé en « Office franco-allemand pour les énergies renouvelables » (OFAEnR) par une déclaration commune des Ministres de l’Écologie français et allemand.
En 2016, l’Office a connu un nouvel élargissement de ses activités à l’ensemble des domaines relatifs à la transition énergétique en France et en Allemagne. Ainsi, le 18ème Conseil des ministres franco-allemand a acté en avril 2016 le changement de nom de l’association qui devient « l’Office franco-allemand pour la transition énergétique » (OFATE), afin de permettre à l’OFATE d’être « à la hauteur des enjeux de la coopération grandissante dans le domaine de l’énergie entre la France et l’Allemagne » et de poursuivre ainsi sa mission dans un cadre élargi aux nouveaux enjeux du secteur.
Le champ d’action de l’OFATE, initialement articulé autour de l’énergie éolienne et solaire, s’est ainsi progressivement élargi et englobe désormais d’autres filières et sources d’énergies, telles que les bioénergies, ainsi que des sujets transversaux relatifs à la transition énergétique dans les deux pays (intégration des renouvelables au système et au marché, flexibilité, efficacité énergétique, etc.).
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